Wenn Du die Abdeckklappe im Kofferraum abbaust, solltest Du an das Unterdruckelement herankommen. Die beiden Membranen sind über einen Bügel miteinander verbunden und somit in der Lage das Schloss zu betätigen. Wenn Du diesen Bügel bei laufenden Motor leicht hin und her bewegen kannst, dann ist vermutlich kein Unterdruck in der Anlage. Das ganze dann in beiden Zuständen nicht abgeschlossen/abgeschlossen ausprobieren.
Du schreibst aber nun, daß während der Fahrt immerhin eine Richtung (abschließen) funktioniert. Das klingt dann wiederum stark nach Membranschaden, entweder in der Beifahrertür oder am Kofferdeckel. Die Tankdeckelverriegelung hat nur eine Membran, die ist nur beim zusperren in Funktion, fällt somit eigentlich als Fehler schon aus.
Somit wird es wohl auf die Kofferdeckelbetätigung oder eben Beifahrertür hinauslaufen.